資深營養師劉純君提醒，請不要以為紅麴產品具有降膽固醇等的效果，就瘋狂的吃，而是應該了解這種產品是不能無限制地食用的。如果是使用純化的紅麴產品，更要小心選擇合格廠商，尤其是懷孕中或計畫懷孕的婦女，選擇含紅麴成分的健康食品要注意，若紅麴發酵過程中產生有毒性的橘黴素，就可能有致畸胎性的作用。
而有肝功能異常、酗酒者也不建議食用，若有服用降血脂藥，或服用抗真菌藥物及抗排斥藥物者，最好也不要食用紅麴的健康食品。如果吃了紅麴產品，提醒在兩小時內最好不要喝葡萄柚汁，否則會延長紅麴素Ｋ在血中的濃度。另外，容易脹氣及腸胃不佳的人，劉純君也不建議多吃。
長期食用，安全嗎？
紅糟肉、紅糟鰻魚、紅麴香腸或紅麴餅乾，很多人都是紅糟肉的愛護者，早上天天吃都不嫌膩。劉純君說，在食物中的紅麴濃度沒有那麼高，天天少量吃應該沒有問題，但要注意的是衛生上的問題。
尤其注意業者提供的紅麴是真的紅麴菌，或是橘麴或甚至只是染色的產品，因為衛生署在幾年前曾經抽驗市售的紅麴米，8件中竟驗出5件含有橘黴素，如果紅麴發酵的環境不佳，就可能會產生橘黴素，長期大量食用可能影響肝腎功能。
怕紅糟味者該怎麼做?
雖然很多人希望得到紅麴的益處，但是有些人卻不喜歡紅糟的味道，劉純君說，紅糟口味通常略顯酸甜，而且有特殊的發酵氣味，如果想要從食物中取得紅麴的效用，但又怕紅糟味者，她建議烹調時可以拉長時間，把發酵的味道揮發出來。
劉純君建議，紅麴也可以應用在甜點中，另外，也有人會把紅麴加入麵條的製作，或是麵包中，而重口味的肉類醃漬烹調比較適合。中醫師吳明珠建議，雖然一般新鮮的食材都可以搭配入菜，但一般建議應用在肉類的豬肉、雞肉、魚肉等肉類食物中會比較適合。
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